Selain pembatalan KA Argo Merbabu, KAI juga mencatat empat perjalanan kereta api mengalami keterlambatan kedatangan dengan keterlambatan hingga 300 menit sebagai dampak lanjutan banjir di wilayah Daop 4 Semarang. Kereta api tersebut antara lain KA Blambangan, KA Kertajaya, KA Dharmawangsa, dan KA Sembrani.
KAI menyampaikan permohonan maaf kepada seluruh pelanggan atas ketidaknyamanan yang ditimbulkan akibat pembatalan dan keterlambatan perjalanan tersebut. Sebagai bentuk tanggung jawab layanan, KAI memberikan service recovery kepada pelanggan yang mengalami keterlambatan sesuai dengan ketentuan yang berlaku.
Bagi pelanggan KA Argo Merbabu yang perjalanannya dibatalkan, KAI memberikan pengembalian bea tiket (refund) hingga H+7, yang dapat dilakukan melalui loket stasiun, kanal resmi penjualan tiket, maupun Contact Center KAI 121.
KAI Daop 1 Jakarta mengimbau para pelanggan untuk tetap tenang dan aktif memantau informasi perjalanan terkini melalui aplikasi Access by KAI, media sosial resmi KAI, maupun Contact Center KAI 121.
